本校創立於民國五十一年八月，定名為「基隆市立第四初級中學」，簡稱「基市四中」。首任校長徐凌雲先生親率全校師生胼手胝足，在借尚志國小及博愛救濟院作教室上課，校舍開始創建之時，上下同心一意，篳路藍縷、披荊斬棘，努力經營校園的一草一木，從無到有。
民國五十八年，也就是本校改制為「基隆市立中山國民中學」的第二年，劉家水先生奉調接長本校，全力推展學生體育、童軍活動以及擊劍、舞蹈、藝文、國語文、書法、寫生、壁報等優秀學生之培育，參加校際比賽迭創佳績，校務蒸蒸日上，學生亦漸增多，六十四年頃多達五十九班，學生三千多人。
六十五年，黃由義先生接任校長之後，由於大德國中成立，學區劃分，每年撥出十五班的學生人數劃歸大德國中，使本校從此一直維持在二十六、七班左右。黃校長在任期間，本校被基隆市政府指派為體育發展中心學校、「社教方案」以及推行民族精神教育的示範觀摩學校，屢次舉辦示範教學觀摩會，頗受本市各界的矚目。
七十八年二月一日，黃校長請准退休，陳萬成校長奉調來校，全力爭取社會資源，推展各項社團活動，致使音樂方面男生合唱團在省北區音樂比賽中勇奪優等獎；而男女生管樂隊也在同時獲得北區比賽的甲等獎；田徑方面亦獲北區路跑比賽的冠軍。此外，為了鼓舞教師士氣，激勵進修，使老師們在每年省教育廳所舉辦的命題比賽中都有輝煌的成績表現，間接對學生各科的教學也增益不少。
八十三年陳校長奉調建德國中，當年八月，高校長惠祺先生接任，全力發展管樂、合唱社團，雙雙獲得八十二學年度北區音樂比賽的優等獎；繼而管樂又連獲八十三、八十四學年度北區音樂比賽的 優等獎，為本校發展女生室外管樂隊建立雄厚的基礎。同時，在積極加強學生課業提升升學率上，更勇奪八十六學年度基隆市高中聯考的女生榜首后冠。
歷年來，由於本校各方面諸多優異表現，就在設置完全中學成為既定的國家教育政策趨勢中，本校旋即雀屏中選，被指定為基隆地區第一所改制的學校。八十六年暑假期間，校長邱景濱先生因此榮調本校，負責籌措一切升格事宜。
邱校長上任，首先希望全校上下「人和為貴」，齊心將過去集聚師生智慧力量所建立下來的優良傳統促之永續發展外，更提出「求知、行善、倫理」之辦學理念， 期望全體教師共同努力，教育學生使成為「快樂、幸福、健康」的健全市民，更規劃學校硬軟體設備使具有藝術氣息與教育精神，以期達到校園公園化的理想境界， 發揮境教功能，教化社區民眾，提昇社區民眾水準，進而促使學校成為「社區文化」的推動者。
八十七年四月二十二日本校奉准正式懸掛校牌改制完成，定名為「基隆市立中山中學」。典禮中，市長李進勇先生親臨主持，除對全校教職員工同仁的辛勞表示慰勉之意外，更允諾將全力給予精神及經費上的支援，也 給了本校師生最大的精神鼓舞。一切就緒，旋即籌組高中部招生委員會，積極展開招生各項事宜；首先，敲定第一年招收高中部學生四班，其中一班為體育班，招生三十人，餘為普通班，每班四十人，合計一百五十位學生。繼而辦理申請入學及單獨招生，並且甄聘高中部優秀教師，全心全力教導、照顧學生，使高中部學生與國中部學生同樣享有學校所能給予的一切。本年度學生入學優異獎學金已於十月七日如期頒發，計二十位學生獲獎，每名新台幣貳萬元整，典禮也是由李市長親自主持，足見李市長之重視。
九十二年七月三十一日邱校長屆年滿六十五歲榮退，鄭裕成先生於八月一日榮調為本校校長。鄭校長為本校畢業校友，本著生於斯，長於斯，服務於斯的教育理念，回來為母校打拼。本校也自從經鄭校長的努力打拼，學校校務及學生在各方面的成績表現上都日增上揚。
鄭裕成校長自九十二年八月一日上任以來，每天早出晚歸，以校為家，秉持「給予學生最佳的學習環境」的理念。不斷的耕耘、灌溉這塊教育園地。鄭校長全心投入校務發展，主動積極、勤奮踏實，為學校與學生付出心力，毫無保留奉獻。對學生的行為觀察入微，就連學生的作業也一本一本的批閱，發現學生學習狀況不佳 時，馬上集合學生面談鼓勵，其誠懇務實的態度及默默耕耘的作法，深得全校師生愛戴，期盼中山高中教育品質不斷提昇，學生能展現多元潛能，校舍早日興建完工，中山高中必成為基隆市最具科技化、資訊化與現代化之學校。
九十六年八月基隆三所完全中學校長調動，鄭校長調任於基隆安樂高中，本校由原暖暖高中李鴻章校長接任。
李校長本著積極推動校務，希望能創造團隊型學校，塑造學校為學習型組織，以提升專業素養與優質教學，達到創新教學、營造精緻而愉悅的社區學校為目地，並推展讀書風氣，營造充滿優質學風之校園。
九十八年八月，李鴻章校長於本校退休，原八斗國中吳文貴校長接任。
吳校長以提高行政效率、激勵工作士氣、提昇學生競爭力，善用社會資源四點為辦學理念，本著教育專業與人文關懷精神，建立學校特色，為確保學生素質、提升學生競爭力努力。
一百年八月，基隆市立大德國民中學整併至本校，成為本校之國中部大德分校，資源整併，期使大德分校教學正常化。後因少子化問題停招普通班，惟持續教育和照護家庭失能的慈輝班學生。
一百零六年鄭裕成校長重返本校掌理校務。以其多年帶領優質高中之經驗，凝聚全校共識，齊心努力讓中山鷹揚再起。並期盼：
一、重建典範制度，讓各項校務能順利運作，並提升效能，使學校能永續經營，不會因人廢事。做到教師認真教學、行政用心辦學、家長熱心助學、學生快樂就學、社區肯定辦學之目標。
二、激勵士氣，重新喚起師生之熱情，積極投入學校十二年國教課程地圖之規畫，及教師專業能力之提升，並持續滾動修正學校總體課程、領域教學、主題統整課程、彈性課程與學校本位課程教學與評量，促使學生、教師與家長從中翻轉學習，促進精緻教育的發展。
三、藉由教育部優質化團隊與基隆前導學校工作圈，提升基隆地區親師生及社區之良好溝通，形成共好及互學的學習文化，並持續開放教室、共同參與教學，期能帶好每位學生成為真善美的中山人。讓鷹雄再起，風華重現。
中山高中自民國五十一年籌備創校至今，已有五十多年之歷史。由於歷任校長及全體師長之努力經營，軟、硬體設備已具規模。今後將繼續朝確保學生素質、提昇學生 競爭力而努力，培養學生具有鄉土情、世界觀及終身學習的基本能力，以適應未來學習型社會的學習生涯及發展學校特色、塑造優質校園文化，讓中山成為一所具特色的領航高中。